Чтобы значение способа оплаты (наличный/безналичный расчёт) автоматически подтягивалось в ЭСФ, достаточно указать этот реквизит непосредственно в самом договоре с контрагентом.
Как это сделать
Откройте карточку договора и найдите реквизит «Способ оплаты» — установите в нём нужное значение: наличный или безналичный расчёт. После сохранения договора это значение будет автоматически подставляться в ЭСФ при оформлении документа по данному договору — вручную указывать способ оплаты каждый раз не потребуется.
Таким образом, настройка выполняется один раз на уровне договора, и далее система сама подтягивает нужное значение во все счета-фактуры, оформленные по этому договору.