Такое поведение обычно связано с тем, что документ реализации или сама ЭСФ проведены некорректно относительно друг друга — списание товара произошло не один раз, а дважды из-за нарушенной последовательности документов. Чтобы разобраться в причине, нужно проверить структуру подчинённости документов.
Как это сделать
Откройте проблемный документ (аннулированную ЭСФ или связанную с ней реализацию) и посмотрите его структуру подчинённости — это покажет, какие документы созданы на основании друг друга и как они связаны между собой. По структуре подчинённости можно увидеть, есть ли задвоение: например, если реализация и ЭСФ оказались проведены отдельно, без правильной привязки друг к другу, либо если после аннулирования ЭСФ остались лишние движения по остаткам, которые не были отменены.
Если в структуре подчинённости обнаружится, что документы дублируют друг друга или связаны неправильно — потребуется перепровести их в верной последовательности, либо удалить лишний документ, который вызвал повторное списание остатков.