Причина в том, что в настройках функциональности программы включён не тот уровень — из-за этого документ скрыт из меню Зарплата, блок Налогообложение.
Как исправить:
1. Зайдите в раздел «Администрирование».
2. Откройте пункт «Функциональность».
3. Установите значение «Полная».
После этого документ «Регистрация прочих налогов в целях налогообложения» появится в меню, и вы сможете с ним работать как обычно.